FP2
De ochtend Vrije Training 2 begon met de rijders die meteen de baan op gingen. Deze sessie is nuttig voor rijders om op te warmen en om verschillende bandenspecificaties te testen voordat de kwalificatie begint.

Na slechts 4 minuten verscheen de eerste gele vlag van de sessie, veroorzaakt door een valpartij van Fabio Di Giannantonio in bocht 5. De eerste rondetijden lagen tussen de 1:45 en 1:47. Na de eerste pogingen zag de top vijf er als volgt uit: Bagnaia, Acosta, Oliveira, Miller, Fernandez.

Toen de tweede gemeten ronden voltooid waren, verbeterden de rijders hun tijden en doken ze de 1:44 binnen. Marc Márquez begon toen aan een ongelooflijke vliegende ronde en nam de leiding van de sessie over. Kort daarna kwam echter de tweede gele vlag, want Márquez crashte in bocht 5, hoewel het er aanvankelijk naar uitzag dat hij door zou kunnen gaan. Kort daarna zagen we Marc de marshals helpen om zijn motor uit het grind te halen.

Ondertussen zagen de bandenconfiguraties er als volgt uit: de meeste rijders kozen voor de zachte achterband, terwijl de rest voor medium koos.

Naarmate de sessie halverwege kwam, werden de tijden niet veel beter. De top vijf bestond uit: Márquez, Morbidelli, Bagnaia, Bezzecchi, Nakagami.

Na een snelle stop in de pits keerden de rijders terug naar het circuit. Sommigen wisten zich te verbeteren, waaronder Luca Marini, die opklom naar de derde plaats.

Met nog 5 minuten te gaan nam Pedro Acosta de leiding over van Marc Márquez. Vlak achter hem verbeterde Ai Ogura zich, waardoor het fabrieksduo terugviel naar de derde en vierde plaats. Fabio Quartararo, die het grootste deel van de sessie achteraan in het klassement had gereden, slaagde erin om de top 9 binnen te dringen.

Bij het vallen van de finishvlag eindigde FP2 als volgt met de top 5: Acosta, Ogura, Marc Márquez, Bagnaia, Morbidelli.

Q1
Aan deze kwalificatie namen deel: Aldeguer, Alex Márquez, Morbidelli, Martin, Bastianini, Ogura, Binder, Chantra, Rins, Miller, Nakagami, Oliveira, Viñales. De snelste twee rijders zouden doorgaan naar Q2.

Toen de eerste tijden waren neergezet, zaten de rijders tussen de 1:43 en 1:44, waaruit bleek hoe dicht het veld bij elkaar zat. De eerste twee waren Ogura en Morbidelli.

Alex Márquez, die op het punt stond om door te stoten, zat op de derde plaats. Thuisheld Ai Ogura hield de leiding vast en leek klaar om door te gaan voor zijn thuispubliek.

Toen de sessie ten einde liep met nog 3 minuten te gaan, lanceerden de rijders hun laatste aanvallen. Aldeguer verbeterde zijn ronde en schoof op naar de tweede plaats, terwijl Morbidelli en Alex Márquez aan vliegende ronden begonnen. Aldeguer kwam echter ten val in sector 2, wat een gele vlag opleverde. Ondertussen voltooide Alex Márquez zijn ronde en nam hij even de leiding, maar vrijwel meteen duwden Ogura en Morbidelli hem naar de derde plaats.

Alex reageerde door zich weer te verbeteren en steeg naar de 2e plaats. In de slotseconden crashte Brad Binder in sector 4, wat opnieuw een gele vlag opleverde. Even later crashte Alex Rins ook, wat een tweede gele vlag veroorzaakte. De late gele vlaggen hielpen Alex Márquez om de tweede plaats vast te houden, terwijl anderen hun tijden niet konden verbeteren.

Morbidelli en Alex Márquez gingen door naar Q2.

Q2
De rijders in dit deel van de kwalificatie waren: Bezzecchi, Acosta, Marc Márquez, Mir, Di Giannantonio, Marini, Bagnaia, Quartararo, Fernandez, Zarco, Morbidelli, Alex Márquez.

Na de eerste voltooide vliegende ronden lagen de tijden tussen de 1:43 en 1:44. Pedro Acosta was de enige rijder die nog geen tijd had neergezet, want hij leek wat technische problemen te hebben tijdens zijn eerste ronde.

Vanaf het begin wisselde de voorlopige poleposition voortdurend van eigenaar. Bagnaia nam daarna de leiding over en duwde zijn teamgenoot Marc naar de 2e plaats. Fabio Quartararo verbeterde zich verder en klom van de 7e naar de 3e plaats.

Na een snelle stop in de pits gingen de rijders weer naar buiten. Alex Márquez verbeterde zich naar de 4e plaats, met nog meer dan 3 minuten te gaan. Joan Mir reed vervolgens een sterke ronde en nam de voorlopige pole over van Marc Márquez. Op dat moment was Franco Morbidelli 3e, met Bagnaia als 4e. Alex, die was afgezakt naar de 8e plaats, verbeterde zich weer naar de 4e plaats. Kort daarna zette Quartararo een solide ronde neer en sprong naar de 3e plaats.

De tijden bleven rond de 1:43. Toen, met nog maar een paar seconden te gaan, produceerde Francesco Bagnaia een briljante ronde. Hij pakte de voorlopige pole en eindigde als snelste rijder in Japan met een 1:42.911.

De top vijf eindigde als volgt: Bagnaia, Mir, Marc Márquez, Acosta, Quartararo.