Odpolední trénink na Phillip Islandu se odehrával za zamračeného počasí. V první polovině tréninku jezdci dolaďovali své motocykly a poté přešli do útočného režimu, aby si zajistili umístění v první desítce, protože nejrychlejších deset jezdců získá přímý vstup do zítřejšího Q2.

Po dokončení prvních měřených kol se časy jezdců pohybovaly mezi 1:29 a 1:33 s. Bagnaia, který začal své první měřené kolo, ho nedokončil a vrátil se rovnou do garáže. Vypadal zjevně nespokojeně, což naznačovalo, že problémy z ranního tréninku stále přetrvávají.

Po pěti minutách tréninku už jezdci zajížděli časy kolem 1:28 a byli velmi blízko k tomu, aby se dostali pod 1:27. První desítka vypadala následovně: Acosta, Zarco, Bezzecchi, Di Giannantonio a Binder.

Co se týče konfigurace pneumatik, všichni použili měkkou zadní pneumatiku a většina jezdců zvolila střední nebo tvrdou přední. Marco Bezzecchi byl prvním jezdcem, který se dostal pod hranici 1:27 a převzal vedení od Acosty. Časy byly velmi těsné, všichni v první desítce, kromě Bezzecchiho, se pohybovali v rozmezí 1:28s.

Jak se jezdci stále zlepšovali, většina jezdců v první desítce se nyní pohybovala kolem 1:27 min. Bezzecchi však zůstával v čele. Po 13 minutách byl Bagnaia stále bez zaznamenaného času, zatímco Yamaha si vedla dobře s Quartararou, Millerem a Rinsem, kteří byli všichni v první desítce.

Bezzecchi byl vidět, jak trénuje dlouhé trestné kolo a připravuje se na nedělní závod. Mezitím Bagnaia poskočil na páté místo; jako jeden z mála jezdců používal tvrdou přední pneumatiku.

Navzdory silnému startu do dalšího pokusu Bagnaia ve čtvrtém sektoru nadále ztrácel čas, což mu znemožnilo další zlepšení.

Po dvaceti minutách se v první desítce umístilo: Bezzecchi, Acosta, Di Giannantonio, Quartararo, Bagnaia, Zarco, Miller, Alex Marquez, Binder a Marini.

Ve 25. minutě byla vyvěšena první žlutá vlajka tréninku po havárii Pedra Acosty ve čtvrté zatáčce. Naštěstí se mu podařilo rychle se vrátit na trať. V té chvíli vedl trénink Fabio Di Giannantonio, zatímco většina jezdců byla v boxech.

Když se trénink dostal do své poloviny, několik jezdců, kteří začali dobrá kola, ztratilo v pozdějších sektorech čas a své pokusy zahodili. V první desítce se pak umístili: Di Giannantonio, Bezzecchi, Rins, Acosta, Alex Marquez, Quartararo, Bagnaia, Fernandez, Zarco a Miller.

Zatímco mnoho jezdců zůstalo v boxech, ti, kteří zůstali venku, se snažili zlepšit své časy na čistší trati. Jack Miller pokračoval ve své dobré formě a zlepšil se na druhé místo, zatímco ostatní se postupně vraceli na trať.

V závěrečné části tréninku, kdy se jezdci obvykle snaží dostat do první desítky, téměř všichni zvolili měkkou zadní a střední přední pneumatiku, kromě několika, kteří zůstali u tvrdé přední.

Po 8 minutách do konce závodu bylo pořadí v první desítce následující: Bezzecchi, Quartararo, Alex Marquez, Rins, Fernandez, Acosta, Aldeguer, Miller, Di Giannantonio a Marini.

Několik minut před koncem vypadl Michele Pirro. Brzy poté Fabio Di Giannantonio zlepšil své kolo a posunul se na 2. místo. Během závěrečných pokusů si Bagnaia polepšil na 8. místo, zatímco Pol Espargaró poskočil do první desítky. Bagnaia pak udělal chybu a musel zpomalit, což znamenalo, že pravděpodobně nemohl nastoupit do dalšího letmého kola.

Když se objevila šachovnicová vlajka, jezdci dokončili svá poslední kola. Marini poskočil na 7. místo, zatímco Bezzecchi dále zlepšil svůj čas a potvrdil první místo. Raul Fernandez zajel silné závěrečné kolo a obsadil 2. místo, čímž pokračoval ve své působivé formě. Fermin Aldeguer, který se pokoušel o zlepšení, těsně minul a zůstal mimo první desítku.